随着人类基因组测序的完成,基因功能的研究不断深入和兴起,由此也带动了相关领域科学技术取得划时代的进展.与基因组学、转录组学和蛋白质组学相对应,代谢组学是一门通过对某一生物或细胞内所有低相对分子质量的代谢产物进行定性或定量分析,并用以监测活细胞中化学变化的科学.以往从基因编码到修饰转录再到蛋白表达这一自上而下的研究存在一定的局限,其最大的挑战在于组学数据的生物功能解释及其与临床现象的联系.代谢组学可以实现对某种特定生物所有代谢物进行定性和定量分析,并识别未知代谢产物.有助于在找到底物、产物、中间体和关键酶的基础上,建立起对整个代谢途径的阐述.通过这条代谢途径的调节机制和关键调节点,联合基因组学、转录组学和蛋白质组学阐明了疾病的发生及发展机制.基于代谢组学技术的优势,它已逐步应用在肾脏疾病领域,体现着其无尽的临床价值.本文总结了近年来代谢组学化学分析技术及数据分析技术的研究进展,在此基础上对代谢组学在肾脏疾病中的应用进行了综述.目前,代谢组学已广泛应用于急性肾损伤、慢性肾衰竭,肾毒性损害、糖尿病肾病、多囊肾、肾性尿崩症等肾脏疾病中,另外,代谢组学在前列腺癌、肾移植及急性冠脉综合征中的应用有显著的优势.综上所述,代谢组学与基因组学、转录组学、蛋白质组学相比更具有优势,并将最终引导个性化的分子诊断和疾病治疗.