基于炎症反应相关基因构建BLCA分子亚型和预后模型题录
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2020年阜阳市自筹经费科技计划项目 FK202081018;2022年安徽省临床医学研究转化专项项目 202204295107020031


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    目的通过TCGA数据库中膀胱尿路上皮癌(BLCA)中炎症反应相关基因(IRRGS)的表达数据和临床数据, 构建BLCA分子亚型和预后分子标签, 探索其在BLCA中的预后作用。方法检索TCGA数据库中412例BLCA患者的转录组数据及临床预后数据, 利用R语言中NMF包对BLCA中的IRRGS表达进行无监督聚类分析, 构建基于IRRGS的BLCA分子亚型, 探索不同亚型的预后情况和肿瘤微环境情况;采用LASSO-Cox回归进行BLCA预后相关甲基化标志物筛选, 并构建预后分子标签, 进一步分析其在BLCA中的预后作用。结果基于BLCA转录组数据和生存数据, 发现200种IRRGS中有33种基因与BLCA预后相关(均P<0.05), 基于33种IRRGS构建BLCA分子亚型, 将412例BLCA患者分为3个亚组, 不同亚型具有不同预后, 且不同亚型具有不同肿瘤微环境;基于33种IRRGS采用LASSO-Cox回归分析从中筛选出9种与BLCA预后相关IRRGS(DCBLD2、IL-10、IRAK2、IRF1、LDLR、PVR、RIPK2、SEMA4D、TLR2), 并联合9种IRRGS构建预后分子标签, 结果显示, 该分子标签可以很好地判断BLCA患者预后。结论基于IRRGS构建的BLCA分子亚型, 不同亚型间预后不同;不同亚型间肿瘤微环境不同。基于9种IRRGS构建的BLCA预后分子标签可以很好地判断BLCA预后, 提示IRRGS在BLCA中可发挥重要作用。

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引用格式: 管波;王浩宇;张挺;陈远哲;单卫民.基于炎症反应相关基因构建BLCA分子亚型和预后模型题录[J].国际泌尿系统杂志,2024,(3).

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