目的探讨肾细胞癌患者癌组织中同源异型盒基因B3(HoxB3)、JAG1的表达水平及对临床预后的影响。方法选取2017年1月至2020年1月在本院收治的93例肾细胞癌患者作为观察组, 收集肾细胞癌患者的癌组织标本(肾细胞癌组)及对应的癌旁组织标本(癌旁组)。采用免疫组化法检测肾细胞癌患者的HoxB3、JAG1表达水平。分析HoxB3、JAG1表达与肾细胞癌患者的临床病理特征关系, 采用多因素Cox回归分析影响肾细胞癌患者预后的相关因素。结果肾细胞癌组的HoxB3阳性表达率低于癌旁组, JAG1阳性表达率高于癌旁组(均P<0.001)。共有62例患者存活, 存活率为66.67%。低分化、TNM分期Ⅲ～Ⅳ期、Fuhrman分级Ⅲ～Ⅳ级、有淋巴结转移、有肾包膜受侵的肾细胞癌患者的HoxB3阳性表达率及JAG1阴性表达率低于中/高分化、TNM分期Ⅰ～Ⅱ期、Fuhrman分级Ⅰ～Ⅱ级、无淋巴结转移、无肾包膜受侵的肾细胞癌患者。低分化、TNM分期Ⅲ～Ⅳ期、Fuhrman分级Ⅲ～Ⅳ级、有淋巴结转移、有肾包膜受侵的肾细胞癌患者的3年生存率均降低(均P<0.05)。HoxB3阳性表达、JAG1阴性表达患者的3年生存率高于HoxB3阴性表达、JAG1阳性表达患者[28(80.00%)vs.34(58.62%), 18(85.71%)vs.44(61.11%), 均P<0.05]。TNM分期Ⅲ～Ⅳ期、有淋巴结转移、HoxB3阴性表达、JAG1阳性表达是肾细胞癌患者预后的危险因素(均P<0.05)。结论 HoxB3在肾细胞癌中呈低表达, JAG1在肾细胞癌中呈高表达, 二者均与肾细胞癌的临床病理特征及预后密切相关, 可作为肾细胞癌预后评估的生物学标志物。