目的探讨基于宏基因组学的宏基因组高通量二代基因测序技术(mNGS)在肾移植术后肺部感染诊治方面的应用价值。方法回顾性分析2018年1月至2022年7月期间在郴州市第一人民医院肾移植中心接受治疗的70例肾移植术后肺部感染患者的病史资料。根据是否采用肺泡灌洗液(BALF)的mNGS检测将患者分为mNGS组(32例)和传统组(38例), 其中传统组采用传统检测方法, mNGS组的病原体检测方法包括传统检测和BALF的mNGS检测。传统检测包括标本培养、真菌D葡聚糖实验检测、曲霉菌半乳糖甘露糖检测、巨细胞病毒DNA、肺炎支原体血清学试验。比较两组患者的病原学检测阳性率、住院时间、病死率等临床资料。结果 mNGS组患者的mNGS检测阳性率明显高于同组传统检测方法和传统组的检测阳性率, 差异均有统计学意义(均P<0.05)。mNGS检测方法中的混合性感染检出率高于传统检测方法, 差异有统计学意义(P<0.05)。经过治疗, 传统组有2例(5.26%)患者死亡, 而mNGS组无死亡病例。此外, 传统组和mNGS组的住院时间分别为(17.22±8.62)d和(12.58±10.08)d, 差异有统计学意义(P<0.05)。结论在肾移植术后肺部感染的诊治中, mNGS检测可提高病原体阳性率, 降低住院时间及病死率, 对改善肾移植术后受者预后和经济效益有重要的价值。